Antibody Microarrays Protilátka Microarrays

Antibody Microarrays an Introduction Protilátka Microarrays úvod

For a more in depth article in antibody microarray development and protocols, see our Antibody Microarray article at Molecular Station. Pro více do hloubky článek v protilátky Microarray rozvoj a protokolů, viz naše Antibody Microarray článku na molekulární stanice.

Genomics and DNA microarray technology have allowed us to analyze almost all the mRNAs at one time and determine whether mRNA expression is changed in disease states. However, the concentration of a specific mRNA within a cell is usually poorly correlated with the actual abundance of the protein. Genomika a DNA Microarray technologie umožnily nám analyzovat téměř všechny mRNAs najednou a zjistit, zda mRNA exprese se změní v nemoci států. Nicméně, koncentrace specifické mRNA v buňce je obvykle málo souvisí s aktuální početnost na bílkoviny . mRNA half-lives in a cell may be hours long (even days), whereas protein levels can change quite quickly. mRNA-polovina žije v buňce může být dlouhá doba (i dní), zatímco bílkoviny úrovních může změnit velmi rychle.

DNA microarrays leave much to be desired. DNA microarrays dovolené vždy optimální variantou. They simply measure a STEP in the process leading to the final product, a fully functional protein (even proteins may need post-translational modifications and phosphorylation to function in a certain way!). Jsou jednoduše změřit krok v procesu, který vedl ke konečnému výrobku, plně funkčního proteinu (bílkoviny může potřebovat i post-translační modifikace a fosforylace do funkce v určité cesty!).

By measuring the amount of the specific protein directly, we can measure true expression of gene function . Měřením množství specifické bílkoviny přímo, můžeme měřit pravda vyjádření genových funkcí.

When one takes into consideration the large number of post-translational modifications, Když se vezme v úvahu velké množství post-translační modifikace,

Human cells may contain a million or more different protein variants due to the large numbers of post-translational modifications possible (for example phosphorylation on a different set of residues). In a given disease, one set of these modifications in one protein may be vital in the progression of the disease. Lidské buňky mohou obsahovat milion nebo více různých proteinů variant vzhledem k velkému počtu post-translační úpravy možné (například fosforylace na řadu různých zbytků). V dané choroby, jeden soubor těchto změn v jednom bílkovin může být životně důležité v progresi choroby.

With the current state of antibody microarrays or antibody chips, science may now have solutions to this problem. An antibody microarray slide or "chip" could be spotted with thousands of known antibodies similar to the way a DNA microarray is made, and binding to antibodies on the chip could be measure when a biological sample is added. Při současném stavu protilátky microarrays nebo protilátky čipy, vědy mohou nyní mají řešení tohoto problému. Protilátka Microarray sklíčko nebo "čip" by mohl být spatřen s tisíci známých protilátky podobné tomu, jak se DNA Microarray-li se, a vazbou na protilátky na čipu by mohla být opatření, kdy biologický vzorek, který zní. Protein chips are quickly becoming a fast and high-throughput method of profiling protein changes in disease and various cell conditions and stimuli. Bílkoviny čipy jsou rychle stává rychlou a vysoce-průchodnost metodě profilování bílkovin změny v nemoci a různých buněčných podmínky a podněty.

Why spend 500$ on an antibody when you can have an entire antibody array of 500-2000 antibodies for about $2000? Proč utratit 500 $ na protilátky, když můžete mít celou škálu 500-2000 protilátky protilátky na přibližně $ 2000?

Most Ab antibody microarray chips can be analyzed using standard DNA microarray fluorescent scanning equipment which is readily available in most hospitals and research institutes. The process is simple and the amount of data that is generated is quite large. Většina Ab protilátky Microarray čipy mohou být analyzovány pomocí standardních DNA Microarray fluorescenční skenovací zařízení, která jsou snadno k dispozici ve většině nemocnic a výzkumných ústavů. Celý proces je jednoduchý a množství dat, která je generována je poměrně velký.

Process of using an Antibody Microarray: Procesu pomocí protilátek Microarray:

Extract total cellular proteins from biological samples of interest Extrakt celkových buněčné proteiny z biologických vzorků z úroků
Label extracted proteins with fluorescent dyes (eg Cy-3 and Cy-5) Label bílkoviny extrahované s fluorescenční barviva (např. Cy-3 a Cy-5)
Remove unbound dye (wash) Odstranit nevázaného barviva (prádla)
Incubate labeled proteins with the antibody microarray Inkubujte označené proteiny s protilátkou Microarray
Scan the array Prohledávají pole
Analyze antibody microarray results Analyzovat protilátky Microarray výsledky

Ideas to think of: Myšlenky myslet na:

- Companies will now prepare Custom Antibody and Protein Microarray Chips using peptide immunization or monoclonal antibodies. -- Společnosti se nyní bude připravovat vlastní protilátek a bílkovin Microarray čipy pomocí peptidové vakcíny nebo monoklonální protilátky.

- Differential protein expression analysis can be conducted using antibody microarrays allowing protein profiling. -- Diferenciální exprese proteinů analýzy mohou být provedeny pomocí protilátek proti bílkovině microarrays umožňující profilování.

Suppliers of Antibody Microarrays: Dodavatelé Antibody Microarrays:

Clontech Clontech

Eurogentec - custom antibody microarrays and protein microarrays. Eurogentec - vlastní protilátky microarrays a bílkovin microarrays.

Arrayit - Antibody Microarrays Arrayit - Protilátka Microarrays

Sigma-Aldrich - Antibody Microarray kit. Sigma-Aldrich - Protilátka Microarray kit. Microarray for signalling analysis: Panorama™ Ab Microarray Cell Signaling Kit Microarray pro signalizaci analýza: Panorama ™ Ab Microarray Buňka signalizační Kit