Antibody Microarrays Antibody Microarrays

Antibody Microarrays an Introduction Antibody Microarrays en introduktion

For a more in depth article in antibody microarray development and protocols, see our Antibody Microarray article at Molecular Station. For en mere dybdegående artikel i antistof microarray udvikling og protokoller, se vores Antibody microarray artiklen på Molekylær Station.

Genomics and DNA microarray technology have allowed us to analyze almost all the mRNAs at one time and determine whether mRNA expression is changed in disease states. However, the concentration of a specific mRNA within a cell is usually poorly correlated with the actual abundance of the protein. Genomforskning og DNA microarray teknologi har gjort det muligt for os at analysere næsten alle mRNAs på én gang, og afgøre, om mRNA ekspression er ændret i sygdom stater. Men den koncentration af et bestemt mRNA inden for en celle er normalt dårligt korreleret med den faktiske forekomst af proteinet . mRNA half-lives in a cell may be hours long (even days), whereas protein levels can change quite quickly. mRNA halve liv i en celle kan være timer lang (selv dage), mens protein niveauer kan ændre sig ganske hurtigt.

DNA microarrays leave much to be desired. DNA microarrays lader meget tilbage at ønske. They simply measure a STEP in the process leading to the final product, a fully functional protein (even proteins may need post-translational modifications and phosphorylation to function in a certain way!). De simpelthen måle et skridt i den proces, der fører til det endelige produkt, et fuldt funktionelt protein (selv proteiner kan have behov for post-translationel ændringer og phosphorylering til at fungere på en bestemt måde!).

By measuring the amount of the specific protein directly, we can measure true expression of gene function . Ved at måle størrelsen af den specifikke protein direkte, vi kan måle rigtigt udtryk for gen-funktion.

When one takes into consideration the large number of post-translational modifications, Når man tager i betragtning af det store antal post-translationel ændringer,

Human cells may contain a million or more different protein variants due to the large numbers of post-translational modifications possible (for example phosphorylation on a different set of residues). In a given disease, one set of these modifications in one protein may be vital in the progression of the disease. Menneskelige celler kan indeholde en million eller flere forskellige protein-varianter på grund af det store antal af post-translationel modifikationer muligt (for eksempel fosforylering på et andet sæt af rester). I en given sygdom, en række af disse ændringer i et protein kan være afgørende i progression af sygdommen.

With the current state of antibody microarrays or antibody chips, science may now have solutions to this problem. An antibody microarray slide or "chip" could be spotted with thousands of known antibodies similar to the way a DNA microarray is made, and binding to antibodies on the chip could be measure when a biological sample is added. Med den nuværende tilstand af antistof microarrays eller antistof chips, videnskab mai nu har løsninger på dette problem. Et antistof microarray slide eller "chip" kunne være plettet med tusindvis af kendte antistoffer ligner den måde en DNA microarray er foretaget, og binding til antistoffer på chippen kan måle når en biologisk prøve er tilføjet. Protein chips are quickly becoming a fast and high-throughput method of profiling protein changes in disease and various cell conditions and stimuli. Protein chips er hurtigt at blive en hurtig og høj overførselshastighed metoden med profilering protein ændringer i sygdommen og forskellige celle betingelser og stimuli.

Why spend 500$ on an antibody when you can have an entire antibody array of 500-2000 antibodies for about $2000? Hvorfor bruge 500 $ på et antistof, når du kan få en hel antistof vifte af 500-2000 antistoffer til omkring $ 2000?

Most Ab antibody microarray chips can be analyzed using standard DNA microarray fluorescent scanning equipment which is readily available in most hospitals and research institutes. The process is simple and the amount of data that is generated is quite large. De fleste Ab antistof microarray chips kan analyseres ved hjælp af standard DNA microarray fluorescerende scanning udstyr, som er let tilgængelig i de fleste hospitaler og forskningsinstitutioner. Processen er enkel og mængden af data, der genereres er ganske stor.

Process of using an Antibody Microarray: Proces for at bruge et antistof microarray:

Extract total cellular proteins from biological samples of interest Uddrag samlede cellulære proteiner fra biologiske prøver af interesse
Label extracted proteins with fluorescent dyes (eg Cy-3 and Cy-5) Label udvindes proteiner med fluorescerende farvestoffer (f.eks Cy-3 og CY-5)
Remove unbound dye (wash) Fjern ubundet farvestof (vask)
Incubate labeled proteins with the antibody microarray Inkubér stemplet proteiner med antistoffet microarray
Scan the array Scan det array
Analyze antibody microarray results Analyser antistof microarray resultater

Ideas to think of: Ideer til at tænke på:

- Companies will now prepare Custom Antibody and Protein Microarray Chips using peptide immunization or monoclonal antibodies. -- Virksomhederne vil nu forberede Custom antistof og Protein microarray Chips bruger peptid immunisering eller monoklonale antistoffer.

- Differential protein expression analysis can be conducted using antibody microarrays allowing protein profiling. -- Differentieret protein udtryk analyse kan udføres ved hjælp af antistof microarrays tillade protein profilering.

Suppliers of Antibody Microarrays: Leverandører af antistof Microarrays:

Clontech Clontech

Eurogentec - custom antibody microarrays and protein microarrays. Eurogentec - specifikt antistof microarrays og protein microarrays.

Arrayit - Antibody Microarrays Arrayit - Antibody Microarrays

Sigma-Aldrich - Antibody Microarray kit. Sigma-Aldrich - Antibody microarray kit. Microarray for signalling analysis: Panorama™ Ab Microarray Cell Signaling Kit Microarray for signal analyse: Panorama ™ Ab microarray Cell Signaling Kit