Die Technik immunoelectron Mikroskopie benutzt Antikörper, um den intrazellulären Standort der Strukturen der bestimmten Proteine an der hohen Zerlegung durch Elektronenmikroskopie zu entdecken. 

Antikörper gegen das benötigte Antigen werden mit Goldpartikeln beschriftet und aufgetragen dann an den ultrathin Kapiteln, die dann im Übertragung Elektronenmikroskop überprüft werden.

Die Antikörper, die mit Goldpartikeln der unterschiedlichen Durchmesser beschriftet werden, aktivieren zwei oder mehr gleichzeitig studiert zu werden Proteine.

Die Schwierigkeit mit dieser Technik ist, wenn sie ausreichend das ultrathin Kapitel befleckt, da wenige Moleküle des Antigens in jedem Kapitel anwesend sind.