Η μικροσκόπηση τεχνικής immunoelectron χρησιμοποιεί τα αντισώματα για να ανιχνεύσει την ενδοκυτταρική θέση των δομών των ιδιαίτερων πρωτεϊνών στο υψηλό ψήφισμα από τη μικροσκόπηση ηλεκτρονίων. 

Τα αντισώματα ενάντια στο απαραίτητο αντιγόνο ονομάζονται με τα χρυσά μόρια και εφαρμόζονται έπειτα στα ultrathin τμήματα, τα οποία εξετάζονται έπειτα στο ηλεκτρονικό μικροσκόπιο μετάδοσης.

Τα αντισώματα που ονομάζονται με τα χρυσά μόρια των διαφορετικών διαμέτρων επιτρέπουν σε δύο ή περισσότερες πρωτεΐνες για να μελετηθούν ταυτόχρονα.

Η δυσκολία με αυτήν την τεχνική είναι να λεκιάσει το ultrathin τμήμα επαρκώς, δεδομένου ότι λίγα μόρια του αντιγόνου είναι παρόντα σε κάθε τμήμα.