De techniek immunoelectron microscopie gebruikt antilichamen om de intracellular plaats van structuren van bijzondere proteïnen bij hoge resolutie door elektronenmicroscopie te ontdekken. 

De antilichamen tegen het vereiste antigeen worden geëtiketteerdi met gouden deeltjes en dan toegepast op uiterst dunne secties, die dan in de transmissieelektronenmicroscoop worden onderzocht.

De antilichamen die met gouden deeltjes verschillende diameters worden geëtiketteerdo laten dat twee of meer proteïnen toe gelijktijdig worden bestudeerd.

De moeilijkheid met deze techniek is in het bevlekken van de uiterst dunne sectie voldoende, aangezien weinig molecules van antigeen in elke sectie aanwezig zijn.