Antibody Microarrays Antibody Microarrays

Antibody Microarrays an Introduction Antibody Microarrays en introduksjon

For a more in depth article in antibody microarray development and protocols, see our Antibody Microarray article at Molecular Station. For en mer dyptgående artikkel i antistoffet microarray utvikling og protokoller, se vår Antibody microarray artikkelen via Molecular Station.

Genomics and DNA microarray technology have allowed us to analyze almost all the mRNAs at one time and determine whether mRNA expression is changed in disease states. However, the concentration of a specific mRNA within a cell is usually poorly correlated with the actual abundance of the protein. Genomforskning og DNA microarray teknologi har tillatt oss å analysere nesten alle mRNAs på en tid og finne ut om mRNA-uttrykket er endret i sykdom stater. Imidlertid konsentrasjonen av en bestemt mRNA i en celle er vanligvis dårlig korrelert med den faktiske overflod av proteiner . mRNA half-lives in a cell may be hours long (even days), whereas protein levels can change quite quickly. mRNA halvt liv i en celle kan være timer lange (like dager), mens protein nivåer kan endre seg raskt.

DNA microarrays leave much to be desired. DNA microarrays reiser mye til å være ønsket. They simply measure a STEP in the process leading to the final product, a fully functional protein (even proteins may need post-translational modifications and phosphorylation to function in a certain way!). De bare måle et skritt i den prosessen som førte til det endelige produktet, et fullt funksjonelt protein (selv proteiner trenger post-translational modifikasjoner og phosphorylation å fungere på en viss måte!).

By measuring the amount of the specific protein directly, we can measure true expression of gene function . Ved å måle mengden av de spesifikke proteiner direkte, kan vi måle sant uttrykk av genet fungere.

When one takes into consideration the large number of post-translational modifications, Når en tar i betraktning det store antallet post-translational modifikasjoner,

Human cells may contain a million or more different protein variants due to the large numbers of post-translational modifications possible (for example phosphorylation on a different set of residues). In a given disease, one set of these modifications in one protein may be vital in the progression of the disease. Human celler kan inneholde en million eller flere forskjellige protein varianter på grunn av det store antallet post-translational modifikasjoner mulig (for eksempel phosphorylation på et annet sett av rester). I en gitt sykdom, ett sett av disse endringene i en protein kan være avgjørende i progresjon av sykdommen.

With the current state of antibody microarrays or antibody chips, science may now have solutions to this problem. An antibody microarray slide or "chip" could be spotted with thousands of known antibodies similar to the way a DNA microarray is made, and binding to antibodies on the chip could be measure when a biological sample is added. Med dagens tilstand av antistoffer microarrays eller antistoffer sjetonger, vitenskap kan nå ha løsninger på dette problemet. En antistoffet microarray lysbildet eller "chip" kan bli sett av tusener av kjente antistoffer lik måte som en DNA microarray er gjort, og bindende for antistoffer på chip kan måle når en biologisk prøve er lagt til. Protein chips are quickly becoming a fast and high-throughput method of profiling protein changes in disease and various cell conditions and stimuli. Protein sjetonger er raskt i ferd med å bli en rask og høy overføringshastighet metode for profilering protein endringer i sykdom og ulike celle forhold og stimuli.

Why spend 500$ on an antibody when you can have an entire antibody array of 500-2000 antibodies for about $2000? Hvorfor bruke 500 kr på et antistoff når du kan ha en hel antistoffet rekke 500-2000 antistoffer for ca $ 2000?

Most Ab antibody microarray chips can be analyzed using standard DNA microarray fluorescent scanning equipment which is readily available in most hospitals and research institutes. The process is simple and the amount of data that is generated is quite large. Mest Ab antistoffet microarray sjetonger kan bli analysert ved hjelp av standard DNA microarray fluorescerende skanning utstyr som er lett tilgjengelig i de fleste sykehus og forskningsinstitusjoner. Prosessen er enkel og mengden av data som genereres er ganske stor.

Process of using an Antibody Microarray: Prosessen med å bruke en Antibody microarray:

Extract total cellular proteins from biological samples of interest Pakk totalt cellular proteiner fra biologiske prøver av interesse
Label extracted proteins with fluorescent dyes (eg Cy-3 and Cy-5) Label hentet proteiner med fluorescent dyes (f.eks konjunksjon-3 og CY-5)
Remove unbound dye (wash) Fjern ubundet farge (vaske)
Incubate labeled proteins with the antibody microarray Incubate merket proteiner med antistoff microarray
Scan the array Scan tabellen
Analyze antibody microarray results Analyser antistoffet microarray resultater

Ideas to think of: Ideer til å tenke på:

- Companies will now prepare Custom Antibody and Protein Microarray Chips using peptide immunization or monoclonal antibodies. -- Bedriftene vil nå forberede Tilpasset Antibody og Protein microarray Chips bruker Peptid immunization eller monoclonal antistoffer.

- Differential protein expression analysis can be conducted using antibody microarrays allowing protein profiling. -- Differential protein expression analyser kan utføres ved hjelp av antistoffer microarrays slik at protein-profilering.

Suppliers of Antibody Microarrays: Leverandører av Antibody Microarrays:

Clontech Clontech

Eurogentec - custom antibody microarrays and protein microarrays. Eurogentec - tilpasset antistoffet microarrays og protein microarrays.

Arrayit - Antibody Microarrays Arrayit - Antibody Microarrays

Sigma-Aldrich - Antibody Microarray kit. Sigma-Aldrich - Antibody microarray kit. Microarray for signalling analysis: Panorama™ Ab Microarray Cell Signaling Kit Microarray for signalanlegg analyse: Panorama ™ Ab microarray Cell signalnettverk Kit