Antibody Microarrays Antibody Microarrays

Antibody Microarrays an Introduction Antibody Microarrays en introduktion

For a more in depth article in antibody microarray development and protocols, see our Antibody Microarray article at Molecular Station. För en mer ingående artikel i antibody microarray utveckling och protokoll, se vår Antibody Microarray artikel på molekylär Station.

Genomics and DNA microarray technology have allowed us to analyze almost all the mRNAs at one time and determine whether mRNA expression is changed in disease states. However, the concentration of a specific mRNA within a cell is usually poorly correlated with the actual abundance of the protein. Genforskning och DNA microarray-teknik har vi kunnat analysera nästan alla mRNA på en gång och avgöra om mRNA uttrycket ändras på sjukdom. Men koncentrationen av ett visst mRNA inom en cell är oftast dåligt korrelerade med den faktiska mängden av protein . mRNA half-lives in a cell may be hours long (even days), whereas protein levels can change quite quickly. mRNA halveringstider i en cell kan vara timmar lång (även dagar), medan protein nivåer kan förändras ganska snabbt.

DNA microarrays leave much to be desired. DNA microarrays lämnar mycket att önska. They simply measure a STEP in the process leading to the final product, a fully functional protein (even proteins may need post-translational modifications and phosphorylation to function in a certain way!). De bara mäta ett steg i den process som leder fram till slutprodukten, en fullt fungerande protein (även proteiner kan behöva post-translationella modifieringar och phosphorylation att fungera på ett visst sätt!).

By measuring the amount of the specific protein directly, we can measure true expression of gene function . Genom att mäta mängden av specifikt protein direkt, vi kan mäta sant uttryck av geners funktion.

When one takes into consideration the large number of post-translational modifications, När man beaktar det stora antalet post-translationella modifieringar,

Human cells may contain a million or more different protein variants due to the large numbers of post-translational modifications possible (for example phosphorylation on a different set of residues). In a given disease, one set of these modifications in one protein may be vital in the progression of the disease. Mänskliga celler kan innehålla en miljon eller fler olika proteiner varianter på grund av det stora antalet post-translationella modifieringar möjligt (t.ex. fosforylering i en annorlunda uppsättning av rester). I en viss sjukdom, en uppsättning av dessa förändringar i ett protein kan vara avgörande i förloppet av sjukdomen.

With the current state of antibody microarrays or antibody chips, science may now have solutions to this problem. An antibody microarray slide or "chip" could be spotted with thousands of known antibodies similar to the way a DNA microarray is made, and binding to antibodies on the chip could be measure when a biological sample is added. Med det nuvarande läget i antibody microarrays eller antikroppar chips, vetenskap kan nu ha lösningar på detta problem. En antikropp microarray slide eller "chip" skulle kunna upptäckas med tusentals kända antikroppar liknande sätt som ett DNA microarray görs, och att binda till antikroppar på chipet kan mäta när ett biologiskt prov tillsätts. Protein chips are quickly becoming a fast and high-throughput method of profiling protein changes in disease and various cell conditions and stimuli. Protein chips är snabbt bli en snabb och kombinatorisk metod för profilering protein förändringar i sjukdomen och olika cell villkor och stimuli.

Why spend 500$ on an antibody when you can have an entire antibody array of 500-2000 antibodies for about $2000? Varför spendera 500 $ på en antikropp när du kan få en hel antikropp rad 500-2000 antikroppar för ca $ 2000?

Most Ab antibody microarray chips can be analyzed using standard DNA microarray fluorescent scanning equipment which is readily available in most hospitals and research institutes. The process is simple and the amount of data that is generated is quite large. Mest Ab antibody microarray chips kan analyseras med hjälp av vanliga DNA microarray fluorescerande scanning utrustning som är lätt tillgänglig i de flesta sjukhus och forskningsinstitut. Processen är enkel och den mängd data som genereras är ganska stor.

Process of using an Antibody Microarray: Process för att använda en antikropp Microarray:

Extract total cellular proteins from biological samples of interest Utdrag totala cellulära proteiner från biologiska prover av intresse
Label extracted proteins with fluorescent dyes (eg Cy-3 and Cy-5) Label utvinns proteiner med fluorescerande färger (t.ex. Cy-3 och Cy-5)
Remove unbound dye (wash) Ta bort obundna dye (tvätt)
Incubate labeled proteins with the antibody microarray Inkubera heter proteiner med antikroppen microarray
Scan the array Scan matrisen
Analyze antibody microarray results Analysera antibody microarray resultat

Ideas to think of: Idéer att tänka på:

- Companies will now prepare Custom Antibody and Protein Microarray Chips using peptide immunization or monoclonal antibodies. -- Företagen kommer nu att förbereda Custom Antibody och Protein Microarray Chips använda peptide immunization eller monoklonala antikroppar.

- Differential protein expression analysis can be conducted using antibody microarrays allowing protein profiling. -- Differential protein-uttrycks-analyser kan genomföras med hjälp av antikroppar microarrays låta protein profilering.

Suppliers of Antibody Microarrays: Leverantörer av Antibody Microarrays:

Clontech Clontech

Eurogentec - custom antibody microarrays and protein microarrays. Eurogentec - specialanpassade antibody microarrays och protein microarrays.

Arrayit - Antibody Microarrays Arrayit - Antibody Microarrays

Sigma-Aldrich - Antibody Microarray kit. Sigma-Aldrich - Antibody Microarray kit. Microarray for signalling analysis: Panorama™ Ab Microarray Cell Signaling Kit Microarray för signalering analys: Panorama ™ Ab Microarray Cellsignalering Kit